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	<title>Super Statisticienne &#187; Dashboard</title>
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	<description>Statistiques, R et paillettes...</description>
	<lastBuildDate>Sat, 19 Nov 2016 14:52:42 +0000</lastBuildDate>
	<language>fr-FR</language>
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	<item>
		<title>R sur le web : le package “shiny”</title>
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		<comments>https://superstatisticienne.fr/r-sur-le-web-le-package-shiny/#comments</comments>
		<pubDate>Sat, 06 Feb 2016 13:56:49 +0000</pubDate>
		<dc:creator><![CDATA[superstatisticienne]]></dc:creator>
				<category><![CDATA[R]]></category>
		<category><![CDATA[R-shiny]]></category>
		<category><![CDATA[Web]]></category>
		<category><![CDATA[Dashboard]]></category>
		<category><![CDATA[DataVisualisation]]></category>
		<category><![CDATA[Shiny]]></category>
		<category><![CDATA[WebApp]]></category>

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		<description><![CDATA[R est un super outil pour les analyses statistiques, qui permet notamment de réaliser tout un tas de graphiques hautement personnalisables afin de rendre la présentation de résultats attrayante et parlante. Un package indispensable pour venir compléter la puissance de R est, selon moi, le package &#171;&#160;shiny&#160;&#187; qui permet d’aller encore plus loin en publiant [&#8230;]]]></description>
				<content:encoded><![CDATA[<p><strong>R</strong> est un super outil pour les analyses statistiques, qui permet notamment de réaliser tout un tas de graphiques hautement personnalisables afin de rendre la présentation de résultats attrayante et parlante.<br />
Un package indispensable pour venir compléter la puissance de R est, selon moi, le <span style="color: #923887;"><strong>package &laquo;&nbsp;shiny&nbsp;&raquo;</strong></span> qui permet d’aller encore plus loin en publiant vos résultats d’analyses sur le web ! Si vous ne le connaissez pas déjà, je vous conseille d’y jeter un oeil, ça va changer votre vie ;-)</p>
<p><span id="more-436"></span><br />
&nbsp;<br />
<span style="color: #923887;"><strong>- Shiny : qu’est-ce que c’est ? -</strong></span></p>
<p><a title="shiny_package" href="https://cran.r-project.org/web/packages/shiny/index.html" target="_blank">Shiny</a> est un package R, développé par <a title="rstudio" href="https://www.rstudio.com/" target="_blank">RStudio</a>, qui permet la création de pages web interactives sur lesquelles il est possible de réaliser toutes les analyses / actions disponibles sous R.</p>
<p>Sa grande force est le fait qu’il n’y a absolument pas besoin de connaître ni HTML, ni CSS, ni Javascript : tout se fait directement en R ! Cela fait de ce package un outil très puissant et très prisé des fans de R ^^<br />
&nbsp;</p>
<p><span style="color: #923887;"><strong>- Shiny : à quoi ça ressemble ? -</strong></span></p>
<p>Pour voir quelques exemples d’applications shiny, voici plusieurs liens :</p>
<ul>
<li>Galerie Shiny (avec des exemples de bases) : <a title="shiny_gallery" href="http://shiny.rstudio.com/gallery/" target="_blank">http://shiny.rstudio.com/gallery/</a></li>
<li>&laquo;&nbsp;Shiny user showcase&nbsp;&raquo; (avec des exemples un peu plus complexes et sophistiqués) : <a title="shiny-user-showcase" href="https://www.rstudio.com/products/shiny/shiny-user-showcase/" target="_blank">https://www.rstudio.com/products/shiny/shiny-user-showcase/</a></li>
<li>&laquo;&nbsp;Show me Shiny&nbsp;&raquo; (pas mal d&rsquo;autres exemples intéressants) : <a title="showmeshiny" href="http://www.showmeshiny.com/" target="_blank">http://www.showmeshiny.com/</a></li>
</ul>
<p>&nbsp;</p>
<p><span style="color: #923887;"><strong>- Shiny : comment ça marche ? -</strong></span></p>
<p>Après avoir installé et chargé le package &laquo;&nbsp;shiny&nbsp;&raquo; dans R (pour l’installation de package R, voir par exemple <a title="les-packages-r" href="http://superstatisticienne.fr/les-packages-r/" target="_blank">ici</a>), il faut créer son application shiny qui sera composée de deux fichiers : un fichier &laquo;&nbsp;<strong>ui.R</strong>&nbsp;&raquo; et un fichier &laquo;&nbsp;<strong>server.R</strong>&nbsp;&raquo; .</p>
<p>La partie &laquo;&nbsp;ui&nbsp;&raquo; : <u>U</u>ser <u>I</u>nterface script, contrôle la mise en page et l&rsquo;apparence de l&rsquo;application.<br />
La partie &laquo;&nbsp;server&nbsp;&raquo; : Server script, contient les instructions dont l&rsquo;ordinateur a besoin pour construire l&rsquo;application.</p>
<p><u>Exemple basique</u> (<em>issu du tutoriel officiel</em>) :</p>
<p>> &laquo;&nbsp;ui.R&nbsp;&raquo; :</p>
<p></p><pre class="crayon-plain-tag">library(shiny)

# Define UI for application that draws a histogram
shinyUI(fluidPage(

  # Application title
  titlePanel("Hello World!"),

  # Sidebar with a slider input for the number of bins
  sidebarLayout(
    sidebarPanel(
      sliderInput("bins",
                  "Number of bins:",
                  min = 5,
                  max = 50,
                  value = 30)
    ),

    # Show a plot of the generated distribution
    mainPanel(
      plotOutput("distPlot")
    )
  )
))</pre><p> </p>
<p>> &laquo;&nbsp;server.R&nbsp;&raquo; :</p>
<p></p><pre class="crayon-plain-tag">library(shiny)

# Define server logic required to draw a histogram
shinyServer(function(input, output) {

  # Expression that generates a histogram. The expression is
  # wrapped in a call to renderPlot to indicate that:
  #
  #  1) It is "reactive" and therefore should
  #     re-execute automatically when inputs change
  #  2) Its output type is a plot

  output$distPlot &lt;- renderPlot({
    x    &lt;- faithful[, 2]  # Old Faithful Geyser data
    bins &lt;- seq(min(x), max(x), length.out = input$bins + 1)

    # draw the histogram with the specified number of bins
    hist(x, breaks = bins, col = 'skyblue', border = 'white')
  })
})</pre><p> </p>
<p>Puis pour lancer l’application et la tester :</p><pre class="crayon-plain-tag">shinyApp(“C:/monchemin/mondossiercontenantlesfichiersR/”)</pre><p></p>
<p><a href="http://superstatisticienne.fr/wp-content/uploads/2016/02/demo1.jpg"><img src="http://superstatisticienne.fr/wp-content/uploads/2016/02/demo1.jpg" alt="demo1" width="976" height="571" class="alignnone size-full wp-image-580" /></a><br />
&nbsp;</p>
<p><span style="color: #923887;"><strong>- Shiny : et ensuite ? -</strong></span></p>
<p>Une fois qu’on est satisfait de son appli &laquo;&nbsp;shiny&nbsp;&raquo;, il va falloir procéder à son <strong>déploiement</strong>, c’est-à-dire la mettre sur le net (pour l’instant tout avait été fait en local).</p>
<p>Pour cela plusieurs options : soit passer par la plateforme <a title="shinyapps" href="http://www.shinyapps.io/" target="_blank">&laquo;&nbsp;shinyapps.io&nbsp;&raquo;</a> mise à disposition par RStudio (très pratique si on veut faire des tests ou partager rapidement son appli), soit passer par l’installation d’un serveur shiny (tout à fait faisable sur une instance AWS par exemple).</p>
<p>Pour plus de détails sur ces étapes, voir les liens suivants : <a title="shinyapps" href="http://www.shinyapps.io/" target="_blank">http://www.shinyapps.io/</a> et <a title="shiny-server" href="https://www.rstudio.com/products/shiny/shiny-server/" target="_blank">https://www.rstudio.com/products/shiny/shiny-server/</a>.</p>
<p>> Exemple avec le lien vers l&rsquo;appli de démo présentée plus haut, hébergée sur &laquo;&nbsp;shinyapps.io&nbsp;&raquo; : <a href="https://superstatisticienne.shinyapps.io/demo1/" title="demo1" target="_blank">https://superstatisticienne.shinyapps.io/demo1/</a><br />
&nbsp;</p>
<p><span style="color: #923887;"><strong>- Shiny : pour aller plus loin -</strong></span></p>
<p>Il existe également un autre package plus ou moins &laquo;&nbsp;dérivé&nbsp;&raquo; de celui-ci : le package <a title="shinydashboard" href="https://cran.r-project.org/web/packages/shinydashboard/index.html" target="_blank">&laquo;&nbsp;shinydashboard&nbsp;&raquo;</a>. Il présente des fonctionnalités similaires mais un &laquo;&nbsp;design de base&nbsp;&raquo; de l&rsquo;appli un peu différent, plus proche des &laquo;&nbsp;tableaux de bords&nbsp;&raquo; (d&rsquo;où son nom ^^) très à la mode en ce moment.</p>
<p>Et pour les graphiques, de nombreux packages permettent la mise en place de graphiques dynamiques basés sur du Javascript, tels que par exemple : &laquo;&nbsp;<em>ggvis</em>&nbsp;&raquo; , &laquo;&nbsp;<em>rCharts</em>&nbsp;&raquo; , &#8230;</p>
<p>A la recherche d’aide pour la création de votre appli &laquo;&nbsp;shiny&nbsp;&raquo; avec R ?<br />
Il y a plusieurs possibilités telles que par exemple :</p>
<ul>
<li>Pour commencer, le tutoriel &laquo;&nbsp;shiny&nbsp;&raquo; : <a title="shiny_tuto" href="http://shiny.rstudio.com/tutorial/" target="_blank">http://shiny.rstudio.com/tutorial/</a></li>
<li>Le support technique de RStudio (si besoin) : <a title="rstudio_support" href="https://support.rstudio.com/hc/en-us" target="_blank">https://support.rstudio.com/hc/en-us</a></li>
<li>Le Google Group &laquo;&nbsp;shiny-discuss&nbsp;&raquo; (pour des questions générales sur la création d’appli shiny) : <a title="shiny-discuss" href="https://groups.google.com/forum/#!forum/shiny-discuss" target="_blank">https://groups.google.com/forum/#!forum/shiny-discuss</a></li>
<li>Le Google Group &laquo;&nbsp;shinyapps-users&nbsp;&raquo; (pour des questions techniques plutôt liées au déploiement) : <a title="shinyapps-users" href="https://groups.google.com/forum/#!forum/shinyapps-users" target="_blank">https://groups.google.com/forum/#!forum/shinyapps-users</a></li>
<li>Et toujours, le forum &laquo;&nbsp;Développez.com&nbsp;&raquo; dédié à R : <a title="dvp_r" href="http://www.developpez.net/forums/f1179/autres-langages/autres-langages/r/" target="_blank">http://www.developpez.net/forums/f1179/autres-langages/autres-langages/r/</a></li>
</ul>
<p>[<a href="http://www.r-bloggers.com/shiny-0-13-0/" title="shiny-0-13-0" target="_blank">NEWS du 12/01/2016</a>] De nouvelles fonctionnalités très intéressantes ajoutées dans la dernière version de &laquo;&nbsp;shiny&nbsp;&raquo; (version 0.13.0), telles que par exemple des templates HTML, la possibilité de créer des événements Javascript et aussi des &laquo;&nbsp;gadgets shiny&nbsp;&raquo; (voir <a href="http://shiny.rstudio.com/articles/gadgets.html" title="shiny-gadgets" target="_blank">ici</a>) ^^</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>Sinon, de mon côté, j’ai déjà réalisé quelques applis shiny de tests et je travaille encore sur d’autres actuellement, je vous en reparle un de ces jours ;-)</p>
<p><span style="color: #923887;"><strong>&#8211;&gt; Et vous, avez-vous déjà testé le package R &laquo;&nbsp;shiny&nbsp;&raquo; ? Avez-vous des exemples d’appli à nous faire partager ?</strong></span></p>
<p>&nbsp;</p>
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